Bioinformatik, 6 hp
Bioinformatics, 6 credits
732A51
Huvudområde
StatistikUtbildningsnivå
Avancerad nivåKurstyp
Fristående- och programkursExaminator
Krzysztof BartoszekKursansvarig
Krzysztof BartoszekStudierektor eller motsvarande
Jolanta PielaszkiewiczTillgänglig för utbytesstudenter
JaKontaktinformation
Isak Hietala
Kursen ges för | Termin | Veckor | Block | Språk | Ort/Campus | VOF | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Fristående kurs (Halvfart, Dagtid) | HT 2020 | 202045-202102 | 3 | Engelska | Linköping, Valla | ||
Fristående kurs (Halvfart, Dagtid) | HT 2020 | 202045-202102 | 3 | Engelska | Linköping, Valla |
Huvudområde
StatistikUtbildningsnivå
Avancerad nivåFördjupningsnivå
A1NFörkunskapskrav
- Kandidatexamen om 180hp inklusive självständigt arbete om 15hp på fördjupningsnivå i något av följande ämnen:
- matematik
- tillämpad matematik
- statistik
- bioinformatik
- datavetenskap
- Godkänd Statistik, grundkurs
- Godkänd Datavetenskap, grundkurs
- Engelska 6/B
(Undantag för Svenska)
Lärandemål
Efter avslutad kurs ska den studerande på en avancerad nivå kunna:
- redogöra för begrepp inom molekylärbiologi och ha en primär förståelse för olika tekniker som används för att generera data.
- reodgöra för viktiga algoritmer och principer för statistiska modeller som används för analys av högdimensionella molekylära data.
- tillämpa några av de viktigaste datorprogrammen inom bioinformatik och statistik på molekylära data-exempel.
Kursinnehåll
Kursen introducerar grundläggande molekylärbiologiska begrepp och hur man analyserar data med bioinformatik och statistik. Mer specifikt innehåller kursen:
- Grunder av molekylär biologi och genetik,
- Gömda Markov kedjor, genetisk sekvensanalys,
- Sekvenslikhet, sekvensgruppering,
- Återuppbyggnad av fylogeni,
- Kvantitativ dragmodellering,
- Analys av mikromatriser,
- Nätverksbiologi.
Undervisnings- och arbetsformer
Undervisningen består av föreläsningar och datorövningar. Föreläsningarna ägnas åt presentationer av begrepp och metoder. Datorövningarna ger praktisk erfarenhet av statistisk analys av molekylära genetiska data. Hemarbete och egna studier är ett nödvändigt komplement till kursen. Kursens undervisningsspråk är engelska.
Examination
Skriftliga labrapporter från datorövningarna. En sista skriftlig eller muntlig tentamen. Detaljerad information om examinationen finns i kursens studiehandledning.
Om LiU:s koordinator för studenter med funktionsnedsättning har beviljat en student rätt till anpassad examination vid salstentamen har studenten rätt till det. Om koordinatorn istället har gett studenten en rekommendation om anpassad examination eller alternativ examinationsform, får examinator besluta om detta om examinator bedömer det möjligt utifrån kursens mål.
Studerande, vars examination underkänts två gånger på kursen eller del av kursen, har rätt att begära en annan examinator vid förnyat examinationstillfälle.
Den som godkänts i prov får ej delta i förnyat prov för högre betyg.
Betygsskala
ECTS, ECÖvrig information
Planering och genomförande av kurs ska utgå från kursplanens formuleringar. Den kursvärdering som ska ingå i varje kurs ska därför behandla frågan om hur kursen överensstämmer med kursplanen.
Kursen bedrivs på ett sådant sätt att både mäns och kvinnors erfarenhet och kunskaper synliggörs och utvecklas.
Institution
Institutionen för datavetenskapDet finns inga examinationsmoment att visa.
Denna flik innehåller det material som är publikt i Lisam. Den information som publiceras här är inte juridiskt bindande, sådant material hittar du under övriga flikar på denna sida.
Det finns inga filer att visa.