Publicerad forskning baserad på beräkningsanalys har ofta lidit av ofullständiga metodbeskrivningar; otillgänglig rådata; och ofullständig och odokumenterad eller otillgänglig kod. Detta förhindrar reproduktion av resultat från sådana studier. Termen "reproducerbar forskning" har använts för att beskriva tanken att en vetenskaplig publikation ska distribueras tillsammans med all rådata, metadata, kod och beräkningsmiljön för att reproducera publikationen. Som en del av SciLifeLab Linköpings seminarieserie 2024 vill NBIS bjuda in till ett seminarium med fokus på reproducerbarhet inom bioinformatik. Vi kommer att introducera NBIS tjänster och ge dig en introduktion till verktyg och beräkningssystem som kan hjälpa dig att arbeta mer reproducerbart.
Program onsdagen den 11 december kl. 13:0016:00
- 13:00 Introduktion till NBIS-tjänster - Malin Larsson
- 13:20 AIDA data hub Sensitive Data Services - Erik Ylipää
- 14:00 Verktyg för reproducerbar forskning. Introduktion och allmän datahantering - John Sundh
- 14:30 -15:00 Fika
- 15:00 Verktyg för reproducerbar forskning. Arbetsflödeschefer - John Sundh
- 15:40 Eventuellt en NBIS användarberättelse – TBA
Plats: Wrannesalen, CMIV, Linköpings Universitetssjukhus.
Via zoom: länk tillgänglig efter registrering
Läs mer om våra verksamheter:
National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS)
AIDA Data Hub
Välkommen!