2022 Hendrik Arnold de Weerd, Julia Åkesson, Dimitri Guala, Mika Gustafsson, Zelmina Lubovac-Pilav (2022) MODalyseR-a novel software for inference of disease module hub regulators identified a putative multiple sclerosis regulator supported by independent eQTL data Bioinformatics Advances, Vol. 2 Vidare till DOI Rasmus Magnusson, Olof Rundquist, Min Jung Kim, Sandra Hellberg, Chan Hyun Na, Mikael Benson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum, Jesper N. Tegner, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Johan Mellergård, Claudio Altafini, Jan Ernerudh, Maria Jenmalm, Colm Nestor, Min-Sik Kim, Mika Gustafsson (2022) RNA-sequencing and mass-spectrometry proteomic time-series analysis of T-cell differentiation identified multiple splice variants models that predicted validated protein biomarkers in inflammatory diseases Frontiers in Molecular Biosciences, Vol. 9, Artikel 916128 Vidare till DOI Georgia Papapavlou Lingehed, Sandra Hellberg, Jesse Huang, Mohsen Khademi, Ingrid Kockum, Hanna Carlsson, Ivar Tjernberg, Maria Svenvik, Jonas Lind, Marie Blomberg, Magnus Vrethem, Johan Mellergård, Mika Gustafsson, Maria Jenmalm, Tomas Olsson, Jan Ernerudh (2022) Plasma protein profiling reveals dynamic immunomodulatory changes in multiple sclerosis patients during pregnancy Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI Alberto Zenere, Olof Rundquist, Mika Gustafsson, Claudio Altafini (2022) Multi-omics protein-coding units as massively parallel Bayesian networks: Empirical validation of causality structure iScience, Vol. 25, Artikel 104048 Vidare till DOI Olof Rundquist, Colm Nestor, Maria Jenmalm, Sandra Hellberg, Mika Gustafsson (2022) Progesterone Inhibits the Establishment of Activation-Associated Chromatin During T(H)1 Differentiation Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI
Hendrik Arnold de Weerd, Julia Åkesson, Dimitri Guala, Mika Gustafsson, Zelmina Lubovac-Pilav (2022) MODalyseR-a novel software for inference of disease module hub regulators identified a putative multiple sclerosis regulator supported by independent eQTL data Bioinformatics Advances, Vol. 2 Vidare till DOI
Rasmus Magnusson, Olof Rundquist, Min Jung Kim, Sandra Hellberg, Chan Hyun Na, Mikael Benson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum, Jesper N. Tegner, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Johan Mellergård, Claudio Altafini, Jan Ernerudh, Maria Jenmalm, Colm Nestor, Min-Sik Kim, Mika Gustafsson (2022) RNA-sequencing and mass-spectrometry proteomic time-series analysis of T-cell differentiation identified multiple splice variants models that predicted validated protein biomarkers in inflammatory diseases Frontiers in Molecular Biosciences, Vol. 9, Artikel 916128 Vidare till DOI
Georgia Papapavlou Lingehed, Sandra Hellberg, Jesse Huang, Mohsen Khademi, Ingrid Kockum, Hanna Carlsson, Ivar Tjernberg, Maria Svenvik, Jonas Lind, Marie Blomberg, Magnus Vrethem, Johan Mellergård, Mika Gustafsson, Maria Jenmalm, Tomas Olsson, Jan Ernerudh (2022) Plasma protein profiling reveals dynamic immunomodulatory changes in multiple sclerosis patients during pregnancy Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI
Alberto Zenere, Olof Rundquist, Mika Gustafsson, Claudio Altafini (2022) Multi-omics protein-coding units as massively parallel Bayesian networks: Empirical validation of causality structure iScience, Vol. 25, Artikel 104048 Vidare till DOI
Olof Rundquist, Colm Nestor, Maria Jenmalm, Sandra Hellberg, Mika Gustafsson (2022) Progesterone Inhibits the Establishment of Activation-Associated Chromatin During T(H)1 Differentiation Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI
Möjligt att förutse risken för svåra biverkningar av cancerbehandling En del som genomgår behandling mot cancer får livshotande biverkningar. LiU-forskare har nu utvecklat en prediktionsmodell som kunde förutsäga vilka patienter som hade hög risk baserat på analys av deras arvsmassa.
Artificiell intelligens hittar sjukdomsrelaterade gener Ett artificiellt neuralt nätverk kan hitta mönster i stora mängder genuttrycksdata och upptäcka grupper av sjukdomsrelaterade gener. LiU-forskarna hoppas att deras tillvägagångssätt på sikt ska kunna tillämpas inom precisionsmedicin.
29 miljoner till MS-forskning vid LiU Går det a tt ta fram en matematisk modell för att kunna förutspå sjukdomsförloppet hos multipel skleros? Det hoppas Mika Gustafsson, universitetslektor vid IFM, som fått 29 miljoner kronor av SSF för ett fem år långt forskningsprojekt.
Möjligt att förutsäga hur multipel skleros utvecklas Immunceller hos patienter med multipel skleros fungerar annorlunda än celler från friska individer. Den skillnaden har forskare vid LiU utnyttjat för att utveckla en metod som kan förutsäga sjukdomsaktivitet vid multipel skleros.
Translationell bioinformatik Genom att analysera styrningen av immunförsvaret vill vi utveckla skräddarsydd läkemedelsbehandling utan biverkningar.
2022 Hendrik Arnold de Weerd, Julia Åkesson, Dimitri Guala, Mika Gustafsson, Zelmina Lubovac-Pilav (2022) MODalyseR-a novel software for inference of disease module hub regulators identified a putative multiple sclerosis regulator supported by independent eQTL data Bioinformatics Advances, Vol. 2 Vidare till DOI Rasmus Magnusson, Olof Rundquist, Min Jung Kim, Sandra Hellberg, Chan Hyun Na, Mikael Benson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum, Jesper N. Tegner, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Johan Mellergård, Claudio Altafini, Jan Ernerudh, Maria Jenmalm, Colm Nestor, Min-Sik Kim, Mika Gustafsson (2022) RNA-sequencing and mass-spectrometry proteomic time-series analysis of T-cell differentiation identified multiple splice variants models that predicted validated protein biomarkers in inflammatory diseases Frontiers in Molecular Biosciences, Vol. 9, Artikel 916128 Vidare till DOI Georgia Papapavlou Lingehed, Sandra Hellberg, Jesse Huang, Mohsen Khademi, Ingrid Kockum, Hanna Carlsson, Ivar Tjernberg, Maria Svenvik, Jonas Lind, Marie Blomberg, Magnus Vrethem, Johan Mellergård, Mika Gustafsson, Maria Jenmalm, Tomas Olsson, Jan Ernerudh (2022) Plasma protein profiling reveals dynamic immunomodulatory changes in multiple sclerosis patients during pregnancy Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI
Hendrik Arnold de Weerd, Julia Åkesson, Dimitri Guala, Mika Gustafsson, Zelmina Lubovac-Pilav (2022) MODalyseR-a novel software for inference of disease module hub regulators identified a putative multiple sclerosis regulator supported by independent eQTL data Bioinformatics Advances, Vol. 2 Vidare till DOI
Rasmus Magnusson, Olof Rundquist, Min Jung Kim, Sandra Hellberg, Chan Hyun Na, Mikael Benson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum, Jesper N. Tegner, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Johan Mellergård, Claudio Altafini, Jan Ernerudh, Maria Jenmalm, Colm Nestor, Min-Sik Kim, Mika Gustafsson (2022) RNA-sequencing and mass-spectrometry proteomic time-series analysis of T-cell differentiation identified multiple splice variants models that predicted validated protein biomarkers in inflammatory diseases Frontiers in Molecular Biosciences, Vol. 9, Artikel 916128 Vidare till DOI
Georgia Papapavlou Lingehed, Sandra Hellberg, Jesse Huang, Mohsen Khademi, Ingrid Kockum, Hanna Carlsson, Ivar Tjernberg, Maria Svenvik, Jonas Lind, Marie Blomberg, Magnus Vrethem, Johan Mellergård, Mika Gustafsson, Maria Jenmalm, Tomas Olsson, Jan Ernerudh (2022) Plasma protein profiling reveals dynamic immunomodulatory changes in multiple sclerosis patients during pregnancy Frontiers in Immunology, Vol. 13 Vidare till DOI