Fotografi av Mika Gustafsson

Mika Gustafsson

Professor

Universitetslektor i translationell bioinformatik

Publikationer

2024

Samuel Schäfer, Martin Smelik, Oleg Sysoev, Yelin Zhao, Desiré Eklund, Sandra Lilja, Mika Gustafsson, Holger Heyn, Antonio Julia, Istvan A. Kovacs, Joseph Loscalzo, Sara Marsal, Huan Zhang, Xinxiu Li, Danuta Gawel, Hui Wang, Mikael Benson (2024) scDrugPrio: a framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases Genome Medicine, Vol. 16, Artikel 42 Vidare till DOI

2023

Julia Åkesson, Sara Hojjati, Sandra Hellberg, Johanna Raffetseder, Mohsen Khademi, Robert Rynkowski, Ingrid Kockum, Claudio Altafini, Zelmina Lubovac-Pilav, Johan Mellergård, Maria Jenmalm, Fredrik Piehl, Tomas Olsson, Jan Ernerudh, Mika Gustafsson (2023) Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis Nature Communications, Data for: Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis, Vol. 14, Artikel 6903 Vidare till DOI
Alberto Zenere, Sandra Hellberg, Georgia Papapavlou Lingehed, Maria Svenvik, Johan Mellergård, Charlotte Dahle, Magnus Vrethem, Johanna Raffetseder, Mohsen Khademi, Tomas Olsson, Marie Blomberg, Maria Jenmalm, Claudio Altafini, Mika Gustafsson, Jan Ernerudh (2023) Prominent epigenetic and transcriptomic changes in CD4(+) and CD8(+) T cells during and after pregnancy in women with multiple sclerosis and controls Journal of Neuroinflammation, Vol. 20, Artikel 98 Vidare till DOI
David Martinez, Sanjiv Dwivedi, Rebecka Jornsten, Mika Gustafsson (2023) NCAE: data-driven representations using a deep network-coherent DNA methylation autoencoder identify robust disease and risk factor signatures Briefings in Bioinformatics, Vol. 24, Artikel bbad293 Vidare till DOI
Mika Gustafsson, Jan Ernerudh, Tomas Olsson (2023) Data for: Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis

Nyheter

ung kvinna i rullstol.

Svår MS-sjukdom förutsägs med maskininlärning

En kombination av endast 11 proteiner kan förutsäga hur svår multipel skleros (MS) olika personer kommer att få många år framåt i tiden. Proteinerna skulle kunna användas till att individanpassa behandlingen efter hur svår sjukdomen förväntas bli.

Mika Gustafsson och David Martinez kikar in i ett rack i superdatorhallen Kärnhuset, NSC.

Ett steg mot AI-stödd precisionsmedicin

AI som hittar mönster i komplexa biologiska data kan på sikt bidra till individanpassad sjukvård. Forskare vid LiU har tagit fram en AI-stödd metod som bland annat kan användas till att bestämma personers kronologiska ålder och om de är rökare.

gravid kvinna joggar på löpband.

Därför mår kvinnor med multipel skleros bättre när de är gravida

Kvinnor som har multipel skleros blir tillfälligt mycket bättre i sin sjukdom när de är gravida. Nu har forskare kartlagt de gynnsamma förändringar som sker naturligt i immunsystemet under graviditet. Fynden kan visa vägen mot nya behandlingar.

Min forskning

Publikationer

2024

Samuel Schäfer, Martin Smelik, Oleg Sysoev, Yelin Zhao, Desiré Eklund, Sandra Lilja, Mika Gustafsson, Holger Heyn, Antonio Julia, Istvan A. Kovacs, Joseph Loscalzo, Sara Marsal, Huan Zhang, Xinxiu Li, Danuta Gawel, Hui Wang, Mikael Benson (2024) scDrugPrio: a framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases Genome Medicine, Vol. 16, Artikel 42 Vidare till DOI

2023

Julia Åkesson, Sara Hojjati, Sandra Hellberg, Johanna Raffetseder, Mohsen Khademi, Robert Rynkowski, Ingrid Kockum, Claudio Altafini, Zelmina Lubovac-Pilav, Johan Mellergård, Maria Jenmalm, Fredrik Piehl, Tomas Olsson, Jan Ernerudh, Mika Gustafsson (2023) Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis Nature Communications, Data for: Proteomics reveal biomarkers for diagnosis, disease activity and long-term disability outcomes in multiple sclerosis, Vol. 14, Artikel 6903 Vidare till DOI
Alberto Zenere, Sandra Hellberg, Georgia Papapavlou Lingehed, Maria Svenvik, Johan Mellergård, Charlotte Dahle, Magnus Vrethem, Johanna Raffetseder, Mohsen Khademi, Tomas Olsson, Marie Blomberg, Maria Jenmalm, Claudio Altafini, Mika Gustafsson, Jan Ernerudh (2023) Prominent epigenetic and transcriptomic changes in CD4(+) and CD8(+) T cells during and after pregnancy in women with multiple sclerosis and controls Journal of Neuroinflammation, Vol. 20, Artikel 98 Vidare till DOI