Specialpedagogiken studerar de möjligheter och hinder som kan uppstå vid lärande och utveckling. De pedagogiska och didaktiska utmaningar som olikheter och variationer innebär i mötet med barn och elever står i fokus. Särskilt gäller det de barn och elever som pedagogiskt och socialt utmanar skolan och/eller definieras vara i behov av särskilt stöd.
Linköpings universitet har en lång tradition av specialpedagogisk utbildning och forskning. Forskningen är inriktad mot specialpedagogisk didaktik, läs- och skrivsvårigheter, inkludering och särskilda undervisningsgrupper, neuropsykiatriska funktionshinder, grupper och grupprocesser, mobbning, värdegrundsfrågor, konflikthantering samt vuxna studerande med funktionsnedsättningar och vuxna med skriftspråkliga svårigheter.