Nestors forskargrupp (Decoding the Epigenetic Foundations of Human Health)

Avhandlingar från Nestors forskargrupp.
Avhandlingar från Nestors forskargrupp.

Nestor-labbet vid LiU fascineras av hur epigenetiska mekanismer, särskilt X-kromosominaktivering (XCI) hos människor, formar utveckling, hälsa och sjukdom.

Även om XCI balanserar gen¬dosen mellan kvinnor och män, kan den ofullständiga eller varierande tystnaden av vissa gener leda till könsspecifika skillnader i genuttryck och bidra till könsbundna sjukdomar såsom autoimmuna sjukdomar, till exempel systemisk lupus erythematosus.

Vi kombinerar traditionell molekylärgenetik med den senaste genominriktade tekniken och bioinformatiken för att studera kromosomer och genuttryck på allelnivå. Vår verktygslåda omfattar nanopore-sekvensering med långa läsningar, single-cell-multiomik och CRISPR-baserad epigenetisk modifiering, vilket gör det möjligt för oss att kartlägga, mäta och manipulera epigenetiska tillstånd, inklusive XCI, över hela genomet med hög upplösning.

Vi låter oss också lätt distraheras av nya spännande tekniker, älskar att utveckla egna metoder och kan lägga orimligt mycket tid på att testa gränserna för den senaste genomteknologin – för det är ju halva nöjet med vetenskap!

Forskargrupp

Utvalda publikationer

Omslag för publikation 'A whole-organism landscape of X-inactivation in humans'
Björn Gylemo, Maike Bensberg, Colm Nestor (2025)

eLIFE , Vol.14 Vidare till DOI

Omslag för publikation 'A landscape of X-inactivation during human T cell development'
Björn Gylemo, Maike Bensberg, Viktoria Hennings, Christina Lundqvist, Alessandro Camponeschi, Dóra Goldmann, Huan Zhang, Aida Selimovic, Antonio Lentini, Olov Ekwall, Colm Nestor (2024)

Nature Communications , Vol.15 Vidare till DOI

Omslag för publikation 'TET2 as a tumor suppressor and therapeutic target in T-cell acute lymphoblastic leukemia'
Maike Bensberg, Olof Rundquist, Aida Selimovic, Cathrine Lagerwall, Mikael Benson, Mika Gustafsson, Hartmut Vogt, Antonio Lentini, Colm Nestor (2021)

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , Vol.118 Vidare till DOI

Omslag för publikation 'Omslag till publikation i Science Advances.'
Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, Björn Gylemo, Colm Nestor (2020)

Science Advances , Vol.6 Vidare till DOI

Omslag för publikation 'Nature methods omslag.'
Antonio Lentini, Cathrine Lagerwall, Svante Vikingsson, Heidi K. Mjoseng, Dimitrios Karolos Douvlataniotis, Hartmut Vogt, Henrik Green, Richard R. Meehan, Mikael Benson, Colm Nestor (2018)

Nature Methods , Vol.15 , s.499-+ Vidare till DOI

Omslag för publikation 'Genome Research omslagsbild.'
Colm Nestor, Raffaele Ottaviano, James Reddington, Duncan Sproul, Diana Reinhardt, Donncha Dunican, Elad Katz, J Michael Dixon, David J Harrison, Richard R Meehan (2012)

Genome Research , Vol.22 , s.467-477 Vidare till DOI

Senaste publikationerna från LiU DiVA

2025

Maike Bensberg, Aida Selimovic, Lisa Haglund, Júlia Goldmann, Sandra Hellberg, Colm Nestor (2025) Exposing the DNA methylation-responsive compartment of the leukaemic genome in T-ALL cell lines support its potential as a novel therapeutic target in T-ALL CLINICAL EPIGENETICS, Vol. 17, Artikel 114 (Artikel i tidskrift) Vidare till DOI
Björn Gylemo, Maike Bensberg, Colm Nestor (2025) A whole-organism landscape of X-inactivation in humans eLIFE, Vol. 14, Artikel RP102701 (Artikel i tidskrift) Vidare till DOI

2024

Björn Gylemo, Maike Bensberg, Viktoria Hennings, Christina Lundqvist, Alessandro Camponeschi, Dóra Goldmann, Huan Zhang, Aida Selimovic, Antonio Lentini, Olov Ekwall, Colm Nestor (2024) A landscape of X-inactivation during human T cell development Nature Communications, Vol. 15, Artikel 10527 (Artikel i tidskrift) Vidare till DOI

2022

Rasmus Magnusson, Olof Rundquist, Min Jung Kim, Sandra Hellberg, Chan Hyun Na, Mikael Benson, David Gomez-Cabrero, Ingrid Kockum, Jesper N. Tegner, Fredrik Piehl, Maja Jagodic, Johan Mellergård, Claudio Altafini, Jan Ernerudh, Maria Jenmalm, Colm Nestor, Min-Sik Kim, Mika Gustafsson (2022) RNA-sequencing and mass-spectrometry proteomic time-series analysis of T-cell differentiation identified multiple splice variants models that predicted validated protein biomarkers in inflammatory diseases Frontiers in Molecular Biosciences, Vol. 9, Artikel 916128 (Artikel i tidskrift) Vidare till DOI
Olof Rundquist, Colm Nestor, Maria Jenmalm, Sandra Hellberg, Mika Gustafsson (2022) Progesterone Inhibits the Establishment of Activation-Associated Chromatin During T(H)1 Differentiation Frontiers in Immunology, Vol. 13, Artikel 835625 (Artikel i tidskrift) Vidare till DOI

Nyheter

Man i högtidsdräkt på en scen

06 oktober 2025

Professorer och pristagare får egen akademisk högtid

Nya professorer installeras, pristagare hyllas och Årets alumner uppmärksammas vid den akademiska högtiden den 10 oktober. Linköpings universitet växer och från och med i år firas två akademiska högtider, en på våren och en nytillkommen på hösten.

23 april 2025

Pristagaren: "Genetik är lite som Vilda västern"

Colm Nestor har utsetts till 2025 års mottagare av Onkel Adams pris för framstående forskning vid Medicinska fakulteten. Han forskar om genetiska förklaringar till varför autoimmuna sjukdomar och infektioner drabbar kvinnor och män i så olika grad.

Flera personer arbetar på labb.

11 februari 2025

Forskning sprider ljus över könsskillnader i sjukdomar

LiU-forskare gjorde en oväntad upptäckt när de undersökte kvinnor som har unik genetisk egenskap. Insikterna från denna forskning bidrar till en bättre förståelse av människans mest gåtfulla kromosom – X-kromosomen.

Forskningsfinansiärer

Logotype Swedish Child Cancer Foundation

Logotype Region Östergötland.


Logotype of The Swedish Cancer Society.

 

 

 

Logotype of The Joanna Cocozza Foundation.

Logo Swedish research council.

 

 

LiU Cancer's logotype.

Organisation