Under AFMs paraply finns forskare från institutionerna för fysik, kemi och biologi (IFM), teknik och naturvetenskap (ITN), samt ekonomisk och industriell utveckling (IEI) vid Linköpings universitet.
Styrgruppen för AFM utses av rektorn. Den har som uppgift att sköta, planera och besluta om verksamheten. Det är också styrgruppen som beslutar om hur AFM ska finansiera forskningsprojekt.
Totalt är ungefär 250 forskare involverade i projekt som helt eller delvis finansieras av AFM.
För att säkerställa tillväxten av nästa generations materialforskare investerar AFM också pengar i forskarskolan Agora Materiae. Skolan har funnits sedan 2012 och har som syfte att hjälpa forskarstuderande inom forskningsområdet för nya funktionella material.